Autor: Agencia EFE

Entrenan una lA que predice la actividad interna de las células
Entrenan una lA que predice la actividad interna de las células [TenDencias]a inteligencia arti L cial está cambiando la investigación en los laboratorios de biología y biomedicina. Ahora, un equipo científico ha logradocrear un nuevo sistema capaz de predecir el funcionamiento interno de las células, lo que podría influir en la comprensión del cáncer y otras enfermedades.
Esta nueva inteligencia artificial (IA) trabaja de los manera semejante a modelos de lenguaje, como ChatGPT, que utilizan un conjunto de datos de entrenamiento para identificar las pautas subyacentes -la gramática del lenguaje y en el nuevo caso los estados y mecanismos celulares-, y luego aplicar esas reglas inferidas a nuevas situaciones. Para esta ocasión, se ha entrando a un modelo de aprendizaje profundo, denominado GET, con datos de más de 1,3 millones de células de 213 tipos obtenidas de tejidohumano sano.
Detrás deesta nueva IA hay cientí-“Estamos trabajando muyactivamente en la siguiente versión de GET 2.0”. “GET es el principio, mi grupo en Columbia está ahora expandiendo el método a más de 50 millones de células, y con aplicaciones en el estudio de distintos cánceres (tu-del Programa de Genómica Matemática en la citada universidad.
En los últimos años, la acumulación de cantidades masivas de datos de células y modelos de IA potentes, como AlphaFold de Google o ESMFold de Meta, diseñados para revelar la estructura de las proteínas, están empezando a transformar la biología en una ciencia más predictiva. Para avanzar en este su campo, Rabadán y equipo diseñaron la nueva IA para predecir qué genes están activos en cé lulas concretas. Esta información sobre la expresión génica -proceso por el que se obtienen protefnasa partir de genespuede indicar la identidad de la célula y cómo realiza sus funciones. “La expresión es como el volumen de cada gen, unos están apagados y otros se expresan mucho; hay genes que se expresan mucho en una célula y poco en otra. Lo que GET aprende es la “gramática” de qué genes se expresan en cada célula”, explica a EFE Rabadán. Ofuncionan las células o cómo responderían ante un cambio, como una mutación cancerígena.
“Tener la capacidad de predecir con exactitud las actividades de una célula nuestra transformaría comprensión de los procesos biológicos fundamentales”, afirma en un comunicado de Columbia el investigador, directordicionales de investigación en biología son buenas para revelar cómo las células realizan su trabajo o reaccionan ante las perturbaciones, pero no pueden predecir cómomas, entre otros). SE BUSCA ENTENDER CÓMO SE IDENTIFICA LA CÉLULA Y DE QUÉ MANERA REALIZA DIVERSAS FUNCIONES. ficos de la Universidad de Estados UniColumbia, dos, liderados por el español Raúl Rabadán, experto en biología de sistemas y genómica de cáncer.
Los detalles de GET (siglas en inglés de transformador general de expresión génica) se publicaron recientemente en la revista Nature y, tal y como confirma a EFE Rabadán, el algoritmo es público, está a disposición de toda la comunidad científica. mores de cerebro, linfoLas aplicaciones son mes”, recalca el investigador. Las herramientas traenor-. Su utilización podría entregar información sobre cómo operan enfermedades como el cáncer, entre otras. [TenDencias] SHUTTERSTOCK