EL CIENTÍFICO QUE BUSCA ANTIBIÓTICOS EN MOLÉCULAS DE ESPECIES EXTINTAS
EL CIENTÍFICO QUE BUSCA ANTIBIÓTICOS EN MOLÉCULAS DE ESPECIES EXTINTAS eu, Hace 30 años que no se descubre uno nuevo y César de la Fuente quiere lograrlo. ¡unLEoN Efe ace 30 años que la ciencano descubre un antibiótico nuevo, poreso, señala el investigador César de la Fuente, hay buscar moléculas "en todas partes", incluso en nuestros parientes más cercanos, como los neandertales, y 'enotros organismos extintos, comoel mamut: "Queremosexplorar todoel árboldela vida". De la Fuente trabaja en la Universidad de Pensilvania, EE.
UU,, y leva casi una década aplicando herramientas deinteligenciaartificial (A) pararebuscar, en cada rincón dela biología «viva y extinta-, moléculas con potencial antibiótico, para frenarlo que cada vezmáses un problema de salud mundial: las bacterias resistentes. "Hemos logrado acelerar dramáticamente nuestra capacidad para descubrir nuevos antibióticos", indica a Efe el investigador español; al día de hoy, forman parte desu "biblioteca molecular" más de un millón de péptidos -cadenas cortas de aminoácidos conocidas porsu potencial como antibióticos innovadores-, que él y su equipo han encontrado en neandertales, denisovanos, mamuts lanudos, elefantes de colmillosrectos y perezosos gigantes, todas ellas extintas, y enlasaliva y el microbioma humano, en vísceras de cerdo, plantas y muchos otros organismos marinos y terrestres. nismos marinos y terrestres. ¿POR QUÉNO HAY NUEVO? De la Fuente explica que son múltiples los factores que han entorpecidoel hallazgo deantibióticos totalmente nuevos-solose han "modificado mínimamente" las estructuras dealgunos: cada vez hay menos inversión y no hay incentivos a nivel de mercado.
Además, durante mucho tiempo se pensó que el problema-combatir bacterias estaba resuelto porque existían fármacos que funcionaban, lo que "desincentivó" a científicos y compañías, que dirigieron su mirada al cáncer y otras enfermedades. otras enfermedades. otras enfermedades. a A Pero con el tiempo, como ya advirtió Alexander Fleming descubridor de la penicilinaen su discurso de aceptación del Nobel, las bacterias se han ido haciendo cada vez más resistentes: existe una brecha de muchos años sin innovación en nuevos antibióticos. A esto, añade el investigador español, hay que sumar quelos métodos tradicionales demuestro y laboratorio para hallar moléculas novedosas "están un poquito obsoletos.
Descubrir algo interesante puede llevar entre 6 y 7 años, más tiempo del quesetardaen completar un doctorado, y ni siquiera está garantizado". Aquí, asevera, es donde entran en juego las máquinas: "Los algoritmos pueden acelerar el proceso". Se trata de aprovechar varias décadas de información biológica disponible en forma de secuenciación de proteomas -el conjunto de proteínas producidas por un organismo y codificadas en su genoma-; genomas -todos los genes de un organismo-; y metagenomas -el conjunto completo de material genético presente en una comunidad microbiana en un entorno específico-. Y aplicar luego los algoritmos adecuados para encontrar, en esa inmensidad de datos, moléculas escondidas. "Es hacer ciencia a velocidad digihacer ciencia a velocidad digihacer ciencia a velocidad digiEL CIENTÍFICO CÉSAR DE LA FUENTE, ORIUNDO DE LA CORUÑA, TRABAJA EN LA UNIVERSIDAD DE PENSILVANIA. tal", declara el investigador, quien subraya que siempre, para verificar que lo identificado por la IA es correcto, hay quesintetizar en el laboratorio algunos péptidos.
Además, es fundamental probarsu actividad antimicrobiana "in vitro? y en modelos animales, lo que De la Fuente halogrado. "DESEXTINCIÓN MOLECULAR" El primer paso de esta aventura científica fue escudriñar el proteoma humano; graciasa la lA, seidentificaron por primera vez miles de péptidos ocultos con potencial antibiótico. Eso hizo plantearse al equipo que quizás no solo estuvieran ahí, sino también conservados alo largo de la evolución, del árbol dela vida.
Comenzaron a explorar moléculas similares en neandertales y denisovanos y a desarrollar un nuevo paradigma, la "desextinción molecular", queserefiere al proceso deresucitar moléculas de especies extintas para "hacer frente a problemas de hoy en día". La primera de estas moléculas extintas reconocida -hubo que inventarse un nombrefue la 'neandertalina-1"; "fue emocionante", admite el científico. Después vinieron otras y laidea de ir más allá delos antepasados humanos, ampliando la búsqueda a todas las especies extintas conocidas. Para lograrlo, Dela Fuente y su equipo desarrollaron un nuevo modelo de aprendizaje profundo, denominado APEX, entrenado con bases de datos de ADN arcaico de diversos organismos. Estemodelose enfocó en el "extintoma", lainformación genética de organisAmos extintos. Descubrieron la mamutusina-2 del mamut lanudo, la "elefasina-2 del elefante de colmillos rectos o la "hidrodamina-P dela antigua vacamarina.
Algunas moléculas mostraron enratones unaeficacia comparable ala del antibiótico polimixina B, comúnmente usado en hospitales, afirma De la Fuente, para quien aún faltan datos para saber si las moléculas extintas tienen mayor potencial quelas de organismos vivos. quelas de organismos vivos. CUESTIONES BIOÉTICAS Elequipo está pensando ahora los siguientes pasos, porque el objetivo final es desarrollar antibióticos nuevos.
Una opción es crear ellos mismos una empresa para explotar los resultados y diseñar nuevos mecanismos para implementar ensayos clínios, quizása través de una ONG. "El mercadoestároto y hay que explorar nuevas vías". La desextinción es un campo nuevo y su desarrollo abrió un debate ético y sobre cómo patentar estas moléculas. C3 patentar estas moléculas. C3 patentar estas moléculas. C3.